曾用刊名：上海师范学院学报(自然科学版)
《上海师范大学学报(自然科学版)》，双月刊，国内外公开发行。现为国家级火炬计划项目“中国学术期刊综合评价数据库来源期刊”，“中国期刊全文数据库全文收录期刊”。并被德国《数学文摘》(ZM)《中国数学文摘》《中国学术期刊文摘》、瑞典DOAJ (Directory of Open Access Journals)数据库等收录。
自创刊以来，始终以迅速反映上海师范大学理工科各学院、系科的最新科研成果，积极促进国内外学术交流为宗旨。进入21世纪后，《上海师范大学学报（自然科学版）》认真贯彻国家颁布的一系列与出版、编辑业务相关的法定技术标准，严格 执行高校学报和科技期刊的编排规范，向着编辑现代化的目标稳步迈进。经过多年的不懈努力，刊物的稿件质量、编校质量、印刷装帧质量有了显著提高，所发表论文的引用率和转摘率也持续呈现出较快的上升趋势。2000年以来，两次获得“中国学术期刊标准化优秀奖”；2006年获得上海市新闻出版局、上海市科委联合颁发的“编校质量优良期刊奖”； 2010、2015年荣获教育部“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖；2011年获中国高校科技期刊研究会第二届全国高师学报系统“十佳学报”和“十佳编辑部”称号。2013年7月获中国高校科技期刊研究会高师学报系统的“高校学科建设贡献奖”。2014年、2016年两度获得“上海市高校特色科技期刊”荣誉。在2019年的期刊编校质量检查中取得优秀的评价。